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簡(jiǎn)介

1.儀器簡(jiǎn)介

Fragment Analyzer,簡(jiǎn)稱(chēng)FA ，片段分析儀系統(tǒng)（Agilent 安捷倫 5200,5300,5400，原AATI，Advanced Analytical Technologies）利用自動(dòng)化平行毛細(xì)管電泳技術(shù)，重新定義了核酸 QC 分析的邊界，可平行分離 12，48 或 96 個(gè)樣品。該系統(tǒng)旨在提高實(shí)驗(yàn)室的效率和工作流程，幫助您自動(dòng)分析大量樣品并專(zhuān)注于結(jié)果。可與世界領(lǐng)先的自動(dòng)化系統(tǒng)聯(lián)用，現(xiàn)在可以通過(guò)自動(dòng)化系統(tǒng)全天候進(jìn)行 DNA 和 RNA 樣品的分析。

該系統(tǒng)可對(duì) gDNA、小 RNA、cfDNA、大片段 DNA 和總 RNA 等多種樣品進(jìn)行 DNA QC 和 RNA QC。這些系統(tǒng)可以分離樣品類(lèi)型的多樣性使這些儀器成為個(gè)性化工作流程的理想工具。使用定量試劑盒分析 NGS 文庫(kù)、大片段彌散條帶、基因組 DNA、RNA 和小 RNA。此外，您還可以使用定性試劑盒分析 PCR 擴(kuò)增子、SSR/微衛(wèi)星、CRISPR 產(chǎn)生的突變或酶解 DNA。

2. Fragment Analyzer片段分析儀系統(tǒng)特點(diǎn)
● 全自動(dòng) 分離膠和樣品自動(dòng)上樣，無(wú)需手動(dòng)灌膠，避免交叉污染
● 高通量可一次檢測(cè)12或96個(gè)樣品，最多為288個(gè)樣品
● 高分辨分辨率為2bp
● 高靈敏檢測(cè)最低濃度可達(dá)5pg/ul
● 運(yùn)行快 15min內(nèi)完成700bp片段分離
● 成本低無(wú)需芯片，毛細(xì)管可反復(fù)利用
● 易操作 PROSize2.0軟件直觀顯示分析結(jié)果
● 用途廣可分析片段范圍為35-40000bp
● 更靈活可提供12，48和96三種型號(hào)的毛細(xì)管列陣

3 Fragment Analyzer（Agilent 安捷倫 5200,5300,5400，原AATI，Advanced Analytical Technologies）片段分析儀技術(shù)參數(shù)
3.1   自動(dòng)進(jìn)樣系統(tǒng)標(biāo)準(zhǔn)要求：標(biāo)準(zhǔn)SBS格式96孔板裝載樣品，12或96個(gè)樣品同時(shí)進(jìn)樣，同時(shí)檢測(cè)。
3.2   進(jìn)樣系統(tǒng)配置要求：3x 96樣品進(jìn)樣托盤(pán)，可實(shí)現(xiàn)無(wú)人值守下288個(gè)樣本連續(xù)進(jìn)樣定性分析或384個(gè)樣本連續(xù)進(jìn)樣定量分析。
3.3   毛細(xì)管電泳分離技術(shù)，96通道毛細(xì)管長(zhǎng)度55cm或者80cm。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段)
3.4   全自動(dòng)儀器，每次標(biāo)本分析都更換新的分離膠。
3.5   分析前全自動(dòng)灌膠。
3.6   全自動(dòng)進(jìn)樣。
3.7   全自動(dòng)進(jìn)Marker和Ladder。
3.8   分析結(jié)束后全自動(dòng)清洗毛細(xì)管。
3.9 分析結(jié)束后全自動(dòng)將毛細(xì)管置入毛細(xì)管保存液中。
3.10    標(biāo)準(zhǔn)分析時(shí)間：15分鐘內(nèi)完成96個(gè)樣本的分析檢測(cè)（小于3kbp樣本）
3.11    檢出限：5 pg/μL，即2ul上述單組分標(biāo)本稀釋12倍后進(jìn)樣，可測(cè)出信噪比大于10：1的信號(hào)。
3.12    動(dòng)態(tài)范圍：從最小至最高優(yōu)于3個(gè)數(shù)量級(jí)。
3.13    樣品要求：PCR產(chǎn)物、基因組DNA、RNA等。樣品無(wú)需純化除鹽等后處理，直接進(jìn)樣分析。
3.14    可檢測(cè)DNA范圍：35～100000bp。最大可測(cè)到10萬(wàn)堿基對(duì)，可對(duì)gDNA基因組DNA進(jìn)行質(zhì)控檢測(cè)。
3.15    突變檢測(cè)靈敏度：可檢測(cè)1000bp大小的DNA片段中1個(gè)堿基突變的存在以及8個(gè)混合樣本中1個(gè)突變樣本的存在。
3.16    適用的試劑盒：基因組DNA，NGS，RNA及常規(guī)片段大小分離試劑盒。
3.17    片段大小計(jì)算精度：優(yōu)于5%,
3.18    光源：長(zhǎng)壽命LED光源（標(biāo)準(zhǔn)壽命超過(guò)10年）激發(fā)波長(zhǎng)470nm。
3.19    檢測(cè)器：高靈敏度CCD檢測(cè)器，檢測(cè)樣本的發(fā)射波長(zhǎng)范圍：500～600nm。
3.20    具備電壓進(jìn)樣和真空進(jìn)樣2種進(jìn)樣方式。
3.21    可同時(shí)放入2種不同類(lèi)型的分離膠，2種不同類(lèi)型的應(yīng)用可不需要人工干預(yù)連續(xù)進(jìn)行，如可連續(xù)進(jìn)行DNA和RNA定性定量分析。

4、PROSize? 2.0 Software

批量分析樣品

使用Batch Processing 可以同時(shí)分析超過(guò)100個(gè)板。設(shè)定好標(biāo)記參數(shù)，可以自動(dòng)化生成報(bào)告。運(yùn)行日志可以查看每板樣品運(yùn)行是否異常，以及是否需要額外注意。

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便捷的樣品標(biāo)記

可以對(duì)每一個(gè)樣品設(shè)定標(biāo)記參數(shù)，也可以對(duì)整板樣品設(shè)定；設(shè)定好的參數(shù)可以保存，下次再用。數(shù)據(jù)可以輸出PDF或者CSV格式。

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5.主要用途：
5.1   用于高通量動(dòng)植物基因組核酸擴(kuò)增產(chǎn)物微衛(wèi)星片段大小分析，即SSR分析。
5.2   用于農(nóng)業(yè)育種反向遺傳學(xué)輻射或化學(xué)誘變突變體篩查，即Tilling分析。
5.3   用于常規(guī)DNA/RNA或擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小定性定量分析。
5.4   用于二代測(cè)序（NGS）過(guò)程中基因組DNA及文庫(kù)的質(zhì)控（定性定量）。
5.5   RNA定性定量分析。
5.6   質(zhì)粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。

6. Fragment Analyzer片段分析儀系統(tǒng)應(yīng)用示例

應(yīng)用示例1：SSR片段分離更快速，分辨率更高

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